1991年，時任齊齊哈爾第一機(jī)床廠教育處副處長曹勇安創(chuàng)辦了民辦黑龍江東亞大學(xué)。1993年黑龍江東亞大學(xué)合并工廠職工大學(xué)后，于1993年12月25日與工廠簽訂了分離合同，走上了一條“自主辦學(xué)，自擔(dān)費用、自我完善、自我發(fā)展”的民辦教育發(fā)展之路，開啟了全國“公轉(zhuǎn)民”辦學(xué)體制改革的先河。2001年3月，學(xué)校成為黑龍江首批高職院校之一， 校名為齊齊哈爾職業(yè)學(xué)院。2011年，學(xué)校經(jīng)教育部批準(zhǔn)升格為普通本科高校，更名為齊齊哈爾工程學(xué)院，成為齊齊哈爾市第一所市屬本科大學(xué)。2019年，學(xué)校順利通過國家本科教學(xué)工作合格評估。

學(xué)校始終堅持社會主義辦學(xué)方向，全面貫徹黨的教育方針，堅持公益性非營利辦學(xué)，堅持應(yīng)用型人才培養(yǎng)，創(chuàng)造了影響中國民辦教育發(fā)展的兩個案例(“混合所有制辦學(xué)”和“院校委托管理”，后者被寫入《國家中長期教育改革和發(fā)展規(guī)劃綱要(2010-2020年)》)，探索出了“政校企合作、產(chǎn)學(xué)研融合、教學(xué)做合一”辦學(xué)模式，凸顯了辦學(xué)優(yōu)勢和辦學(xué)特色，促進(jìn)了學(xué)校各項事業(yè)快速健康發(fā)展。目前，學(xué)校已發(fā)展成為以工學(xué)學(xué)科為主，管理學(xué)、醫(yī)學(xué)、藝術(shù)學(xué)等學(xué)科適度發(fā)展的全日制應(yīng)用型本科院校。學(xué)校系全國唯一具有行政級別、事業(yè)單位編制的民辦高校。

學(xué)?？傉嫉孛娣e86.7萬平方米，建筑面積33萬余平方米;校內(nèi)建有本科實驗場所121個;教學(xué)科研儀器設(shè)備總值7865.43萬元;館藏紙質(zhì)圖書94.49萬冊，電子圖書42.4萬冊;室內(nèi)、外運動場地總面積7萬余平方米;校園環(huán)境優(yōu)美，文化氛圍濃厚。

學(xué)校以地方經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展需求為導(dǎo)向，不斷優(yōu)化專業(yè)布局，設(shè)有機(jī)電工程系、建筑工程系、信息工程系、管理工程系、康護(hù)工程系、馬克思主義學(xué)院等8個二級教學(xué)單位;開設(shè)25個本科專業(yè);現(xiàn)有全日制在校生8400余人。

“艱苦創(chuàng)校 課程立校 文化治校 精神興校 信仰傳?！?， 學(xué)校始終堅持“以學(xué)生為中心”的教育理念，確立了“黨建領(lǐng)引 三全育人，黨政合力 齊抓落地”的工作方針，實施全員“生涯導(dǎo)師制”，創(chuàng)新實踐“三全育人”理念，設(shè)立教育質(zhì)量獎。2015年10月，學(xué)校作為“基層創(chuàng)業(yè)教育孵化平臺”入選首個“全國大眾創(chuàng)業(yè)、萬眾創(chuàng)新活動周”，是唯一參展的地方高校。